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Sistema Asistencial
Engloba a todas las áreas del hospital, que tienen una función asistencial, es decir atención directa del paciente por parte de profesionales del equipo de salud. Hay dos áreas primordiales, en la asistencia directa del paciente, los consultorios externos para atender pacientes con problemas ambulatorios que no requieren internación y las áreas de internación, para cuidado de problemas que sí requieren hospitalización.
 Sistema Administrativo Contable
Este sistema tiene que ver con las tareas administrativas de un hospital. En él se encuentran, áreas como admisión y egreso de pacientes, otorgamiento de turnos para consultorios externos, departamento de recursos humanos, oficinas de auditoria, farmacia, entre otras.
En sí toda oficina trabaja con el público en algún proceso o trámite con documentación, es una oficina administrativa. El área contable del hospital se encarga primariamente de la facturación, de las prestaciones dadas a las entidades de cobertura correspondientes.
Sistema Gerencial
Está compuesto según los hospitales por gerencias o Direcciones. Las más destacada es la Gerencia Médica, que organiza o dirige el funcionamiento global del hospital, sus políticas de prevención, diagnostico y tratamiento, y el presupuesto, entre otros temas.
Sistemas de Información
Se refiere al sistema informático que tiene el hospital y que soporta su funcionamiento en redes de computadoras y programas diseñados especialmente para el correcto funcionamiento de todas las áreas. Es manejada generalmente por un Departamento o gerencia de Sistemas de Información.
Sistema Técnico
Engloba a todas las dependencias que proveen soporte, mantenimiento preventivo y Bioingeniería en una institución.
Sistema de Docencia e Investigación
La docencia en un hospital es un punto clave en la formación de profesionales. La docencia y la investigación están ligadas en varios aspectos. Muchos hospitales poseen sistemas de capacitación y formación de nuevos profesionales como concurrencias, residencias o fellowships, con programas bien organizados para que el nuevo profesional del equipo de salud obtenga la mejor y mayor formación posible.
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